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Como faço pra cadastrar um laboratório(terceirizado) que presta serviços ao municipio?
cadastra ele como um estabelecimento normal;
caracerização / atendimento prestado colocas SADT SUS;
contratos e convencios - coloca o numero do contrato com o municipio e na parte onde pede conta bancária tu tens que colocar, senão dá erro.

E quais sao os comandos pra cadastrar os serviços do laboratorio do hospital do municipio?
se é terceiro no cadastro dos serviços especializados (na ana conjunto/serviços especializados) tu colocas que o laboratorio é terceiro e indica o cnes dele, se o laboratório é próprio do hospital tu vais colocar que ele é próprio.